Titre RNCP 100% CPF

Master 2 Bio-informatique - Parcours type : Développement logiciel et analyse des données (DLAD)

UNIVERSITE D'AIX MARSEILLE

5 600 €à partir de
Durée variabledurée
2sessions actives
Bouches-du-Rhônelieu

Objectifs de la formation

Les étudiants acquerront une formation interdisciplinaire en biologie, informatique et statistique. Les applications biologiques incluront l'analyse de données génomiques, épigénomiques, transcriptomiques et protéomiques, évolutives, et des variations polymorphiques. La formation en informatique s'appuiera sur des cours de programmation, administration de systèmes, ingénierie logicielle, une formation aux bonnes pratiques pour la reproductibilité des résultats scientifiques, le développement de ressources bioinformatiques (bases de données, outils d'analyse) et le déploiement d'interfaces pour ces ressources. Les biostatistiques couvriront inférence statistique, analyse de données multidimensionnelles, modélisation des séquences et apprentissage automatique.

Programme

Semestre 3
- Bibliographic review in preparation to the Master thesis (3 crédits)
- Compléments de mathématiques et statistiques pour la bioinformatique (6 crédits)
- Biological interaction networks (3 crédits)
- Programmation avancée (6 crédits)
- Programmation web: complément (3 crédits)
- Génomique comparative et évolutive (3 crédits)
- Analyses statistiques et bio-informatique des variations génomiques (3 crédits)
- Professionnalisation 3 (3 crédits)
Semestre 4
- Stage de M2 (30 crédits)

Résultats attendus

- Développer une approche pluridisciplinaire qui intègre les concepts et méthodes de biologie, d'informatique, de mathématiques et statistiques afin de décrypter les mécanismes présidant au fonctionnement et à l'évolution du vivant. Ceci inclura :
- savoir analyser des données génomiques de différentes nature pour en extraire l'information pertinente, et interpréter les résultats en termes de mécanismes biologiques ou d'applications (médecine, agriculture, biotechnologie) ;
- savoir élaborer des procédures reproductibles pour l'analyse analyses de données massives ("workflows") ;
- savoir développer un outil informatique original suivant les bonnes pratiques du domaine (programmation collaborative, gestion des versions, documentation du code et des modes d'utilisation) ;
- s'exprimer et produire des rapports scientifiques en anglais.

Les points forts

Ce parcours mène aux métiers de bioinformaticien.ne-développeur.euse et de bioinformaticien.ne-analyste.

La certification

MASTER Bioinformatique (fiche nationale)

RNCP 38964 RS -1 CertifInfo 116852

Organisme & lieu

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